Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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