Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SS18Q15532 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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SS18Q15532 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SS18Q15532 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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SS18Q15532 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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SS18Q15532 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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SS18Q15532 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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SS18Q15532 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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SS18Q15532 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SS18Q15532 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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