Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3GAP1Q15042 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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