Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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