Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE4AQ14139 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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