Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK13Q14004 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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