Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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