Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms