Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOFQ13790 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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