Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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