Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEUROD1Q13562 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms