Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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