Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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