Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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