Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NME3Q13232 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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