Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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