Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCP2Q13094 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms