Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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