Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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FOXC1Q12948 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXC1Q12948 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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