Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STX4Q12846 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms