Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms