Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms