Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNDQ07001 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms