Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms