Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms