Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms