Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms