Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms