Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms