Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms