Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms