Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms