Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS4XP62701 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms