Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V0D1P61421 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms