Protein–RNA interactions for Protein: P61296

HAND2, Heart- and neural crest derivatives-expressed protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAND2P61296 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAND2P61296 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAND2P61296 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAND2P61296 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HAND2P61296 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAND2P61296 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAND2P61296 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAND2P61296 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAND2P61296 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAND2P61296 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAND2P61296 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms