Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAP25P60880 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAP25P60880 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms