Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBP60709 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBP60709 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBP60709 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms