Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABP4P57796 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABP4P57796 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABP4P57796 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms