Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms