Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAG2P55895 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAG2P55895 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAG2P55895 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAG2P55895 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms