Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms