Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGDP52209 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGDP52209 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGDP52209 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGDP52209 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGDP52209 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGDP52209 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGDP52209 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms