Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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