Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP153P49790 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP153P49790 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP153P49790 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP153P49790 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms