Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CX3CR1P49238 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CX3CR1P49238 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CX3CR1P49238 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms