Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms