Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4P46934 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4P46934 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4P46934 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4P46934 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4P46934 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms