Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms