Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP5P45974 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP5P45974 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP5P45974 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP5P45974 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP5P45974 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms