Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEA4P43358 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms